В период с 20 по 21 сентября 2011 г. МРУ Росфинмониторинга по СФО проверялось Филиалом № 1 Государственного учреждения – Новосибирского регионального отделения Фонда социального страхования Российской Федерации.
Каких либо нарушений по результатам проверки выявлено не было (акты № 272 от 30.09.2011, № 272н/с от 30.09.2011, справки № 272 от 21.09.2011, № 272н/с от 21.09.2011).

В период с 19 по 20 сентября 2011 г. МРУ Росфинмониторинга по СФО проверялось Управлением Пенсионного фонда  Российской Федерации в Центральном районе г. Новосибирска.

Каких либо нарушений по результатам проверки выявлено не было (справка № 064/010/552-2011 от 20.09.2011, акт № 064/010/552-2011 от 20.09.2011).

По состоянию на 01 января 2011 года:
В соответствии с программой ревизии финансово-хозяйственной деятельности МРУ Росфинмониторинга по СФО за 2008-2009годы в период с 21.10 по 10.11.2010г. бригадой Территориального управления Росфиннадзора по НСО проведена проверка использования средств федерального бюджета и федерального имущества. В результате ревизии нарушений не установлено, замечаний нет.

В период с 18 по 19 октября 2010 года проведена проверка Управлением Генеральной прокуратуры в СФО соблюдения законодательства МРУ Росфинмониторинга по СФО о противодействии легализации (отмыванию) преступных доходов и финансированию терроризма. В ходе проведенной проверки, нарушений законодательства выявлено не было.   

22.06.2010 проведена проверка Управлением Федеральной службы по надзору в сфере коммуникаций по Новосибирской области работы на франкировальной машине, установленной в МРУ Росфинмониторинга по СФО. По результатам проверки нарушений и замечаний выявлено не было, франкировальная машина соответствует обязательным требованиям в области почтовой связи (акт № А-54-04/0049 от 23.06.2010).