Основными задачами отдела координации и взаимодействия являются:

1. Организация взаимодействия с заинтересованными территориальными органами федеральных органов исполнительной власти и органов власти субъектов Российской Федерации, находящихся в пределах Южного федерального округа по линии противодействия легализации доходов, полученных преступным путем, и финансированию терроризма.

2. Координации деятельности правоохранительных, федеральных и иных органов исполнительной власти в сфере противодействия отмыванию доходов полученных преступным путем и финансированию терроризма.

3. Подготовка ежеквартальных отчетов в прокуратуры субъектов РФ находящихся на территории ЮФО о материалах переданных в правоохранительные органы по ст. 8 Федерального закона №115-ФЗ от 07.08.2001г.

4. Информационно-аналитическое сопровождение материалов Росфинмониторинга, переданных в правоохранительные органы по ст. 8 Федерального закона №115-ФЗ от 07.08.2001г.

5. Организация взаимодействия с правоохранительными органами по  материалам финансовых расследований и подготовка предложений для принятия руководством МРУ Росфинмониторинга  по ЮФО управленческих решений по ним.

6. Участие в семинарах-совещаниях, учебных мероприятиях проводимых правоохранительными органами субъектов РФ находящихся в ЮФО, по вопросам связанным легализацией доходов, полученных преступным путем, и финансированием терроризма.