Статс-секретарь - заместитель директора
Помощники директора
Советники директора
Управление - аппарат директора
Начальник – Косенок Ирина Генриховна
Управление кадров и противодействия коррупции
Начальник - Фролова Анна Вадимовна
Управление документооборота
Начальник - Коваленко Сергей Алексеевич
Управление эксплуатации информационных систем
И.о. начальника управления - Стебихов Алексей Александрович
Управление развития информационных технологий финансового мониторинга
Начальник - Федоров Михаил Николаевич
Управление по противодействию отмыванию доходов
Начальник - Андреев Виталий Вячеславович
Управление по работе с бюджетной сферой
Начальник - Седов Михаил Владимирович
Управление организации надзорной деятельности
Начальник - Виташов Дмитрий Сергеевич
Управление международных связей
Начальник - Петренко Алексей Гурьевич
Управление по противодействию финансированию терроризма
Начальник - Лисицын Антон Сергеевич
Управление координации и взаимодействия
Начальник - Лоскутов Игорь Николаевич
Управление расследований на финансовых рынках
Начальник - Степанов Алексей Алимович
Управление оценки рисков
Начальник - Мозгов Евгений Александрович
Юридическое управление
Начальник - Тисен Ольга Николаевна
Управление безопасности и защиты информации
Начальник – Шумаев Геннадий Иванович
Финансово-экономическое управление
Начальник - Федорова Инна Григорьевна